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不過學術查重寶典要很遺憾告訴大家的是，引用是算文章的重復比例的，只要論文中和學術數據比對庫中的文字有重復了，系統都會判斷相似的，會算在“總文字復制比”里。 如果總文字復制比是27%。 還有一個指標“去除引用文獻復制比”，假設是17%，這個比例是總文字復制比例減去引用后的實際相似比例，實際引用比例占相似比例多少呢？
雖然學術查重系統對比其他系統已經非常之好了，但仍有可能發生。 所幸的是，幾乎所有的評審機構對于重復率要求都是留有余量的。 所以再次聲明，重復率余量不是默認可以抄襲的量，是留給引用和檢測偏差的。
學術查重報告當中有一個全文的重復率部分，還有一個部分是去除引用文獻的重復率部分。 因此，即使論文作者對其他論文進行引用，只要引用格式正確，一般都會被學術查重軟件自動識別為引用部分，以綠色字體標注，在去除引用文獻部分的重復率會有所體現。 所以，格式正確就不算，否則就算。 引用只是少量的使用其他文獻中的觀點和論據，切莫大段落的引用，否則就是抄襲。 論文內容中間引用文獻，需要標記引用符號。 因為忘記或者是懶得標記，又或者是標記符號用錯了，導致文段被標紅的情況每年都有發生，而且還不少。 引用的文字部分最后使用句號。 引用的內容通常會在雙引號“”之間，雙引號完成后使用句號結尾，這是正確的引用方式，如果在雙引號“”中間的部分使用句號，那么句號后面的文字就會被認定為抄襲了。